Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem:
http://ciatej.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1023/446| Estudio de la dinámica poblacional de un cultivo mixto de levaduras silvestres durante la fermentación de mezclas de azúcares empleando técnicas moleculares | |
| EDUARDO JOSE BURGOS VALENCIA | |
| INGRID MAYANIN RODRIGUEZ BUENFIL | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| "Considerando las diferencias observadas en el perfil de asimilación de xilosa para estas cepas individuales, como primera estrategia, se seleccionó al gene xilulosa cinasa (XK) como probable gene marcador para diferenciar a las cepas individuales en los cultivos mixtos. Para esto se diseñaron oligonucleótidos específicos para tres diferentes fragmentos del gene XK con el fin de obtener el mayor número de polimorfismos posibles, y se analizaron las secuencias obtenidas de las cepas T1 y LR2. Para ambas cepas, el conjunto de oligos F1-XK/R1-XK obtuvó un fragmento de 196 pb, el F1-XK/R2-XK uno de 190 pb y el F1-XK/R3-XK uno de 356 pb. Las secuencias presentaron alta identidad (98-99%) con secuencias de XK de C. glabrata encontradas en el GenBank. Las regiones amplificadas traducidas a sus secuencias de aminoácidos presentaron los dominios de carbohidrato-cinasas (Connect 1 y Phospate 2), residuos de aminoácidos de unión de xilulosa, Mg2+ y ATP, y un residuo catalítico de aspartato. Las secuencias amplificadas con el mismo juego de oligonucleótidos tuvieron 100% de identidad para ambas cepas, aunque sí fue posible identificar dos alelos del mismo gene, presentes en ambas cepas. Los fragmentos amplificados con los oligos F1-XK/R1-XK y F1- XK/R3-XK se diferenciaron sólo en la longitud y podrían tratarse del mismo alelo. El alelo amplificado con el conjunto F1-XK/R2-XK presentó una identidad de 98.94% con respecto a los otros dos fragmentos, teniendo una diferencia de dos bases con respecto los otros dos grupos. La identidad entre las secuencias obtenidas impidió usar este gene para diferenciar a las levaduras en cultivos mixtos. Como estrategia adicional en la diferenciación de estas cepas utilizando al gene XK se realizó un análisis de una región 1000 pb río arriba de una secuencia putativa de este gene en C. glabrata (numero de accesión CR380953) encontrada en el GenBank y se halló un elemento GCR1, regulador de enzimas glucolíticas y de la gluconeogénesis que podría servir para este propósito. Como segunda estrategia para la discriminación de estas cepas se utilizó la técnica fingerprinter (REP-PCR), la cual genero un perfil de bandas similar para ambas cepas, aunque si mostró de una a tres bandas especificas para la cepa T1 o LR2. No obstante, estas bandas fueron poco reproducibles por las limitaciones de la técnica y no se recomendó su uso para discriminar ambas cepas en cultivos mixtos." | |
| 30-11-2017 | |
| Tesis de maestría | |
| CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA | |
| Aparece en las colecciones: | MAESTRÍA EN CIENCIAS EN INNOVACIÓN BIOTECNOLÓGICA |
Cargar archivos:
| Fichero | Tamaño | Formato | |
|---|---|---|---|
| Eduardo José Burgos Valencia.pdf | 9.26 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |